一八六一年，七月，清朝咸丰帝过世。
一八六一年九月，安庆被清军曾国藩所部的湘军围攻，不久後陷落，安庆位於长江中游是三省交界处，此地控制华西与华北的交通，战略位置十分重要，失去安庆後天京再无屏障，清军将顺流而下直接攻击天京。安庆陷落後，陈玉成退守庐州，庐州又失守，陈玉成率部突围，与奏王苗沛霖会合之後被苗出卖给清军。陈玉成宁Si不降於河南延津被凌迟处Si，陈玉成一Si，西线的太平天国防线崩溃，对清军的攻势再无招架之力，清军长驱直入。
一八六二年，李鸿章率所办团练淮军搭乘英国轮船进入上海，同洋兵一同武装保卫上海。趁李秀成率军攻略上海被寒冷的天气所阻，同时天京兵力空虚时，曾国藩下排行第九的弟弟人称九帅的曾国荃整军从安庆顺流来到天京占领了战略高地，将天京铁桶似的团团包围，李秀成赶紧调军回师天京，无奈清军工事坚固，援军太多，相持四十余天李秀成仍无法改变天京的围势，只得退兵。
一八六三年六月，在四川征战的石达开走头无路之下向清军投降，旋即被凌迟处Si。李秀成对翼王石达开的评价是：家富读书，文武备足。。石达开是太平天国里我最欣赏的人，一八三一年生於广西贵县，为人豪爽，讲信重义，是乡民眼中的少年英雄，好打抱不平，十六岁即入拜上帝教成为太平军成员，永安时被封为翼王五千岁，连败清军，用兵如神。天京事变後，石达开因受洪秀全之猜忌而出走，接连转战各地，战事不顺，有人认为石达开今非昔b，指挥统兵作战的能力极速下滑，我却认为天京事变後太平军士气低迷，石达开因脱离太平天国，无法与其他太平军首尾呼应协同作战，如同孤军般没有根据地可以补充兵源与给养，影响了他无法大胆用兵，只能退而求稳，而清军经湘军、淮军和楚军等等编练装备完成，洋人又协助清军，所以相对於石达开的太平军，清军的战力可说大幅提升。
一八六三年五月，石达开率军深入四川时部众只剩约三千人而已，穷途末路之下为保全部属他舍命向多次劝降他的四川总督骆秉章投降，事後清军竟食言而肥突袭已缴械的石达开部队，展开屠杀，由此可见骆秉章的人品之不堪。石达开在成都慷慨就义，身受凌迟却始终默然，不置一词，Si的时候仅仅三十二岁；石达开将军有诗一首与诸位共赏：
扬鞭/石达开
扬鞭慷慨莅中原，不为仇雠不为恩。
只觉苍天方愦愦，莫凭赤手拯元元。
三年揽辔悲羸马，万众梯山似病猿。
我志未酬人亦苦，东南到处有啼痕！
唉！出师未捷身先Si，长使英雄泪满襟。我为石达开感到悲痛。好汉，安眠吧，历史已成了你的墓碑，英雄两字我辈已为你刻上。
一八六三年底，清军的攻势迅猛，太平军招架不住，李秀成建议洪秀全离开天京力图再起，洪秀全拒绝。
一八六四年六月一日，洪秀全病Si，洪天贵福即位是为幼天王，Si前他将幼天王托孤给g王洪仁玕。
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